Ce que nous faisons
Le Gene Modulation Services Shared Resource (GMSR), un partenariat entre le Roswell Park Comprehensive Cancer Center et l'Université d'État de New York à Buffalo (UB), fournit un service centralisé et rentable pour soutenir les chercheurs intéressés par la modulation de l'expression des gènes.
La ressource abrite des ARN courts en épingle à cheveux (shRNA) individuels dans des vecteurs rétroviraux ou lentiviraux (140,000 84,000 pour les gènes humains et 9 8.1 pour les gènes analogues), des bibliothèques de criblage de lentivirus shRNA génomiques groupées, des bibliothèques de lentivirus sgRNA inhibiteurs CRISPR ou activateurs CRISPR groupés et des régulateurs dCas13.5 associés, la bibliothèque de lentivirus ORFeome XNUMX humaine avec XNUMX XNUMX clones d'ADNc pleine longueur individuels et divers vecteurs viraux exprimant des marqueurs de sélection (par exemple, GFP ou résistance à la puromycine) ou des gènes d'immortalisation.
Technologie
Bibliothèque d'ARNsh lentiviraux à l'échelle du génome humain Expression Arrest pGIPZ et bibliothèques d'ARNsh rétroviraux à l'échelle du génome humain et murin Expression Arrest pSM2
Ces bibliothèques, achetées auprès de Thermo Fisher (à l'époque Open Biosystems), contiennent environ 62 25,000 constructions shRNAmir uniques ciblant l'ensemble des génomes (> 3 5 gènes) avec environ XNUMX à XNUMX constructions/cible.
Plus d'informations sur ces bibliothèques sont disponibles sur le site de Dharmacon et Site Web de Drexel.
Bibliothèque shRNA du cancer humain avec arrêt de l'expression du pSM2 rétroviral shRNAmir
2311 constructions shRNAmir ciblant 967 gènes humains liés au cancer.
Bibliothèque de criblage shRNA lentiviral humain groupé Dharmacon™ Decode™
Les bibliothèques de criblage d'ARN interférents lentiviraux Decode sont des pools de shRNA Dharmacon™ GIPZ™. Grâce au silençage par ARN interférent de centaines ou de milliers de gènes en parallèle, un criblage d'ARN interférents lentiviraux groupés peut être effectué pour identifier les gènes qui régulent les réponses cellulaires et les voies de signalisation, ou pour découvrir de nouvelles fonctions génétiques.
Pour plus d'informations sur cette bibliothèque, veuillez consulter Site Web de Dharmacon.
Bibliothèques lentivirales humaines et murines DECIPHER™ poolées de shRNA de CELLECTA
Ces shRNA lentiviraux à code-barres ont été conçus pour couvrir l'ensemble des gènes humains et murins annotés avec un pourcentage élevé de séquences fonctionnellement validées et l'inclusion d'un ensemble redondant de cinq à six shRNA par gène. Les bibliothèques DECIPHER sont divisées en modules : trois modules pour l'homme et deux modules pour la souris. Chaque module cible environ 5,000 25,000 gènes ̶ diversement associés à des maladies, des cibles médicamenteuses connues ou des voies de signalisation ̶ et représente plus de 18 XNUMX shRNA uniques. Les bibliothèques utilisent des codes-barres optimisés de XNUMX nt qui facilitent l'identification des shRNA fonctionnels et l'analyse des données de séquençage à haut débit à l'aide de la plateforme Illumina.
Pour plus d'informations sur ces bibliothèques, veuillez consulter Site Internet de Cellecta.
Bibliothèque ORF lentivirale humaine de premier plan du MGC
Cette bibliothèque d'expression ORF lentivirale humaine a été développée grâce aux efforts collaboratifs du Dana-Farber Cancer Institute, du Broad Institute et du Center for Cancer Systems Biology (CCSB). La collection comprend 15597 12861 clones couvrant XNUMX XNUMX gènes.
Pour plus d'informations sur ces bibliothèques, veuillez consulter Site Web de Transomic.
Bibliothèques mutualisées CRISPRi et CRISPRa à l'échelle du génome humain
Bibliothèque d'ARN guide unique CRISPRa (sgRNA) du laboratoire Jonathan Weissman (version 1)
- Présentant le système SunCas9 avec 10 sgRNA pour chaque site de démarrage de la transcription (TTS) dans 15,977 5,968 gènes humains et 198,810 XNUMX témoins pour un total de XNUMX XNUMX sgRNA au total
- Systèmes constitutifs ou régulés par la tétracycline disponibles
- Couverture 190X
Bibliothèque CRISPRi sgRNA du laboratoire Jonathan Weissman (version 1)
- 10 sgRNA pour chaque TSS dans 15,977 11,219 gènes humains et 206,421 XNUMX témoins pour un total de XNUMX XNUMX sgRNA au total
- Couverture 290X
- Test de mycoplasmes basé sur la PCR pour la surveillance de routine des lignées de culture tissulaire
- Emballage rétro- ou lentiviral de constructions fournies par l'utilisateur
- Production de virus infectieux à partir de vecteurs supplémentaires fournis par le noyau, y compris ceux destinés à l'immortalisation cellulaire, à la régulation et au suivi du TET
- Maxiprep d'ADN plasmidique à base de CsCl
Services et tarifs
| Produit ou service | 1-5 Constructions | >5 constructions |
|---|---|---|
| Stock de glycérol – shRNA ou ORF | $52.50 | $26 |
| ADN plasmidique – shRNA ou ORF | $77 | $61 |
| Production de virus pour l'infection d'une lignée cellulaire | $118 | $94 |
| Infection de la lignée cellulaire et sélection d'antibiotiques | $161 | $112 |
| Tests de mycoplasmes | $37.50 | $20 |
| ADN plasmidique purifié au CsCl maxiprep | $246.50 | $145 |
| Transformation bactérienne | $55.50 | $54.50 |
* ADN plasmidique provenant de bibliothèques groupées shRNA ou CRISPR – veuillez nous contacter pour connaître les tarifs
* Surnageant lentiviral à titre élevé provenant de bibliothèques groupées shRNA ou CRISPR – veuillez nous contacter pour connaître les tarifs
Commander
Tests de mycoplasmes
Formulaire de commande pour le test de mycoplasmes
Clones shRNA individuels
- Pour passer une commande, vous aurez besoin du nom officiel du gène. C'est disponible sur le site Web du NCBI.
- Dans la fenêtre de recherche, sélectionnez « gène » et saisissez le nom du gène ou son alias.
- Pour trouver les constructions shRNA disponibles pour votre gène d'intérêt, Visitez ce lien. Vous pouvez effectuer une recherche soit par nom officiel du gène, soit par numéro d'accession. Vous devrez fournir l'ID du clone et l'adresse de la plaque.
- Les demandes de clones et les questions sur les prix et la disponibilité peuvent être envoyées à renae.holtz@roswellpark.org.
Formulaire de commande de clone individuel de shRNA
Plasmides fournis par PI
Formulaire de commande de plasmides fournis par PI
Clones LentiORF
- Pour passer une commande, vous aurez besoin du nom officiel du gène. C'est disponible sur le site Web du NCBI.
- Dans la fenêtre de recherche, sélectionnez « gène » et saisissez le nom du gène ou son alias.
- Pour trouver les constructions LentiORF disponibles pour votre gène d'intérêt, Visitez ce lien.
- Vous pouvez effectuer une recherche soit par nom officiel du gène, soit par numéro d'accession. Vous devrez fournir l'identifiant du clone et l'adresse de la plaque.
- Les demandes de clones et les questions sur les prix et la disponibilité peuvent être envoyées à renae.holtz@roswellpark.org.
Formulaire de commande de clones LentiORF
Suivi de plasmides tels que la luciférase ou la GFP
Formulaire de commande de suivi de plasmide
Production de plasmides CsCl
Emplacement et heures
Centre de lutte contre le cancer de Roswell ParkRessource sur les services de modulation génétique
Centre de génétique et de pharmacologie (CGP), salle L2-135
Rues Elm et Carlton
Buffalo, NY 14263
Du lundi au vendredi, de 8h30 à 4h30
S'il vous plaît contacter:
Irwin Gelman, Ph. D.
Directeur
Téléphone : 716-845-7681
E-mail : Irwin.Gelman@RoswellPark.org
Notre équipe
Coordonnées
Pour toute consultation ou question concernant la conception expérimentale, veuillez contacter le Dr Gelman.
Téléphone : 716-845-7681
E-mail : Irwin.Gelman@RoswellPark.org
Utilisation de la ressource
Les chercheurs intéressés par les services de modulation génétique ou les tests sur les mycoplasmes doivent contacter :
Renae Holtz
Téléphone : 716-845-1585
E-mail : Renae.Holtz@RoswellPark.org