Les modèles de souris cancéreuses, notamment les modèles de souris génétiquement modifiées (GEM) et les xénogreffes (PDX), sont des systèmes populaires pour l'étude des cancers humains dans les laboratoires de recherche et cliniques.
Une question essentielle pour l'utilisation de tout modèle est de déterminer dans quelle mesure le modèle représente fidèlement les homologues humains, en particulier au niveau mutationnel. Les analyses des mutations somatiques de la souris posent un défi unique en raison de la diversité du contexte génétique dans les modèles GEM et de la contamination stromale de la souris dans les modèles PDX.
Nous avons surmonté ces défis en utilisant des approches informatiques spécialement conçues. Les mutations identifiées chez la souris récapitulent les mutations des points chauds du cancer chez l'homme :
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Wei L, Murphy BL, Wu G, Parker M, Easton J, Gilbertson RJ, Zhang J, Roussel MF. L'analyse du séquençage de l'exome de modèles murins de médulloblastome identifie WDR11 comme un suppresseur de tumeur potentiel dans les tumeurs du groupe 3. Oncotarget. 2017 juillet 27 ; 8(39) : 64685-64697. doi : 10.18632/oncotarget.19642. PMID : 29029386 ; PMCID : PMC5630286.
Wei L, Chintala S, Ciamporcero E, Ramakrishnan S, Elbanna M, Wang J, Hu Q, Glenn ST, Murakami M, Liu L, Gomez EC, Sun Y, Conroy J, Miles KM, Malathi K, Ramaiah S, Anbarasu A, Woloszynska-Read A, Johnson CS, Conroy J, Liu S, Morrison CD, Pili R. Le profilage génomique est prédictif de la réponse au traitement par cisplatine mais pas à l'inhibition de PI3K dans les xénogreffes dérivées de patients atteints d'un cancer de la vessie. Oncotarget. 2016 novembre 22 ; 7(47) : 76374-76389. doi : 10.18632/oncotarget.13062. PMID : 27823983 ; PMCID : PMC5363516.
Dang J, Wei L, de Ridder J, Su X, Rust AG, Roberts KG, Payne-Turner D, Cheng J, Ma J, Qu C, Wu G, Song G, Huether RG, Schulman B, Janke L, Zhang J, Downing JR, van der Weyden L, Adams DJ, Mullighan CG. PAX5 est un suppresseur de tumeur dans les modèles murins de mutagenèse de leucémie lymphoblastique aiguë. Sang. 2015 juin 4 ; 125(23) : 3609-17. doi : 10.1182/blood-2015-02-626127. Publication en ligne du 2015 avril 8. PMID : 25855603 ; PMCID : PMC4458800.