Positions
Centre de lutte contre le cancer de Roswell Park
- Professeur agrégé d'oncologie
- Codirecteur, Ressources de base en bioinformatique
- Département de Biostatistique et Bioinformatique
Présentation
Éducation et formation
- Doctorat - Université d'État de New York à Buffalo
- BS - Université des sciences et technologies de Chine
Association
- Chercheur postdoctoral – Hôpital de recherche pour enfants St. Jude
Aperçu de la recherche
Le Dr Wei est un biologiste computationnel financé par le programme R01. Ses recherches portent sur le développement et l'utilisation d'algorithmes computationnels intégratifs pour comprendre la génomique du cancer et d'autres questions biologiques. Les domaines de recherche actuels du Dr Wei comprennent :
- Détection ultra-sensible de lésions cancéreuses et précancéreuses grâce à des mutations somatiques.
- Interprétation précise de variantes génomiques complexes par des annotations prenant en compte les haplotypes.
- Identifier la mutation motrice, l’étiologie, le mécanisme et l’hétérogénéité dans les génomes du cancer humain et murin.
- Développer des logiciels informatiques open source innovants et intégratifs pour la génomique du cancer.
Le Dr Wei a été invité à présenter « Mutations clonales épidermiques induites par les UV et nouvelles perspectives pour la prévention du cancer de la peau » lors du webinaire sur les sciences environnementales et la prévention du cancer (ESCP), Division de la prévention du cancer, Institut national du cancer, Instituts nationaux de la santé, le 22 janvier 2026.
https://prevention.cancer.gov/news-and-events/meetings-and-events/environmental-exposure-related-risk-skin-cancer-webinar
Publications
Yao S*, Wei L*, Hu Q*, Liu S*, Manojlovic Z, Fiorica PN, Long M, Zirpoli GR, Cai Q, Long J, Ping J, Barnard ME, Jin Y, Murakami M, Wang J, Zhu Q, Davis W, Chen J, Ondracek RP, Khoury T, Gandhi S, Takabe K, Ko N, Sanderson M, Hong CC, Bandera EV, Craig DW, Ambrosone CB, Palmer JR, Zheng W, Carpten JD. Profil mutationnel du cancer du sein triple négatif chez les femmes afro-américaines. Nature Genetics. 2025 sept. ; 57(9) : 2166-2176. doi : 10.1038/s41588-025-02322-y. Publication en ligne : 26 août 2025. PMID : 40858906
Wei L§, Fitzgerald ME, Yan L, Murakami M, Grant SR, Hu Q, Fan S, Okai B, Goyal D, Singh PK, Shafirstein G, Remenyik E, Gellen E, Foster BA§, Huss WJ§, Paragh G§. La thérapie photodynamique réduit la charge de petits clones épidermiques induits par les ultraviolets dans la peau humaine et murine. Br J Dermatol. 2024 Aug 27:ljae314. doi: 10.1093/bjd/ljae314. PMID: 39189591
Grant SR, Rosario SR, Patentreger AD, Shary Nico, Fitzgerald ME, Singh PK, Foster BA, Huss WJ, Wei L, Paragh G. HotSPOT : un outil informatique pour concevoir des panels de séquençage ciblés afin d’évaluer la photocarcinogenèse précoce. Cancers. 2023, 15(5), 1612 ; https://doi.org/10.3390/cancers15051612
Merz M*, Merz A*, Wang J*, Wei L*, Hu Q, Hutson N, Rondeau C, Celotto K, Belal A, Alberico R, Block AW, Mohammadpour H, Wallace PK, Tario J, Luce J, Glenn SJ, Singh P, Herr MM, Hahn T, Liu S, McCarthy PL, Hillengass J. Déchiffrer l'hétérogénéité spatiale à l'échelle de la cellule unique dans le myélome multiple. Nature Communications. 10 février 2022 ; 13(1) : 807. doi : 10.1038/s41467-022-28266-z. PMID : 35145077
Hutson N, Zhan F, Graham J, Murakami M, Zhang H, Ganaparti S, Hu Q, Yan L, Ma C, Liu S, Xie J§, Wei L§. Méthode adaptative de définition du statut mutationnel négatif pour la comparaison de plusieurs échantillons par séquençage de nouvelle génération. BMC Medical Genomics. 2021 déc. 2 ; 14(Suppl 2) : 32. doi : 10.1186/s12920-021-00880-8. PMID : 34856988
Wei L*§, Christensen S*, Fitzgerald M, Graham J, Hutson N, Zhang C, Huang Z, Hu Q, Zhan F, Xie J, Zhang J, Liu S, Remenyik E, Gellen E, Colegio O, Lin H, Bax M, Xu J, Huss WJ, Foster BA, Paragh G§. Le séquençage ultra-profond permet de différencier les profils de mutations clonales cutanées associés à l'exposition solaire et à la prévalence du cancer de la peau. Science Advances. 2021 janv. ; vol. 7, n° 1 ; DOI : 10.1126/sciadv.abd7703. PMID : 33523857.
Wei L*, Hussein AA*, Ma Y*, Azabdaftari G, Ahmed Y, Wong LP, Hu Q, Luo W, Cranwell VN, Bunch BL, Kozlowski JD, Singh PK, Glenn ST, Smith G, Johnson CS, Liu S, Guru KA. La quantification précise des cellules cancéreuses résiduelles dans le lavage pelvien révèle une association avec la récidive du cancer après cystectomie radicale robot-assistée. Journal of Urology. 2019 juin;201(6):1105-1114. doi: 10.1097/JU.0000000000000142.
Huss WJ, Hu Q, Glenn ST, Gangavarapu KJ, Wang J, Luce JD, Quinn PK, Brese EA, Zhan F, Conroy JM, Paragh G, Foster BA, Morrison CD, Liu S, Wei L. Comparaison des performances de capture d'exomes SureSelect et Nextera dans le séquençage de cellules uniques. Human Heredity. 2018;83(3):153-162.
Wei L*, Wang J*, Lampert E, Schlanger S, DePriest AD, Hu Q, Gomez EC, Murakami M, Glenn ST, Conroy J, Morrison C, Azabdaftari G, Mohler JL, Liu S, Heemers HV. L’hétérogénéité génomique intratumorale et intertumorale du cancer de la prostate multifocal localisé influence les classifications moléculaires et les facteurs pronostiques génomiques. European Urology. 2017 févr. ; 71(2) : 183-192.
Wei L*§, Liu LT*, Conroy JR, Hu Q, Conroy JM, Morrison CD, Johnson CS, Wang J, Liu S§. MAC : identification et correction des annotations pour les variations multinucléotidiques. BMC Genomics. 2015 août 1 ;16 :569.
Holmfeldt L*, Wei L*, Diaz-Flores E, Walsh M, Zhang J, Ding L, Payne-Turner D, Churchman M, Andersson A, Chen SC, McCastlain K, Becksfort J, Ma J, Wu G, Patel SN, Heatley SL, Phillips LA, Song G, Easton J, Parker M, Chen X, Rusch M, Boggs K, Vadodaria B, Hedlund E, Drenberg C, Baker S, Pei D, Cheng C, Huether R, Lu C, Fulton RS, Fulton LL, Tabib Y, Dooling DJ, Ochoa K, Minden M, Lewis ID, To LB, Marlton P, Roberts AW, Raca G, Stock W, Neale G, Drexler HG, Dickins RA, Ellison DW, Shurtleff SA, Pui CH, Ribeiro RC, Devidas M, Carroll AJ, Heerema NA, Wood B, Borowitz MJ, Gastier-Foster JM, Raimondi SC, Mardis ER, Wilson RK, Downing JR, Hunger SP, Loh ML, Mullighan CG. Le paysage génomique de la leucémie lymphoblastique aiguë hypodiploïde. Nature Genetics. 2013 mars;45(3):242-52.