Qué hacemos
El recurso compartido de servicios de modulación genética (GMSR), una asociación entre el Roswell Park Comprehensive Cancer Center y la Universidad Estatal de Nueva York en Buffalo (UB), proporciona un servicio centralizado y rentable que apoya a los investigadores interesados en modular la expresión genética.
El recurso alberga ARN de horquilla corta individuales (shRNA) en vectores retrovirus o lentivirus (140,000 para genes humanos y 84,000 para genes análogos), bibliotecas agrupadas de detección de lentivirus de shRNA genómico, bibliotecas agrupadas de lentivirus de sgRNA con inhibidores o activadores de CRISPR y reguladores dCas9 asociados, la biblioteca de lentivirus ORFeome 8.1 humana con 13.5 K clones de ADNc de longitud completa individuales y varios vectores de virus que expresan marcadores de selección (por ejemplo, GFP o resistencia a la puromicina) o genes de inmortalización.
Tecnología:
Biblioteca de shRNA humano de genoma completo para lentivirus pGIPZ con detención de expresión y biblioteca de shRNA humano y de ratón de genoma completo para retrovirus pSM2 con detención de expresión
Estas bibliotecas, adquiridas a Thermo Fisher (en ese momento Open Biosystems), contienen ~62 25,000 construcciones shRNAmir únicas dirigidas a genomas completos (>3 5 genes) con ~XNUMX-XNUMX construcciones/objetivo.
Hay más información disponible sobre estas bibliotecas. en el sitio web de Dharmacon y Sitio web de Drexel.
Biblioteca de shRNA de cáncer humano shRNAmir retroviral pSM2 que detiene la expresión
2311 construcciones shRNAmir dirigidas a 967 genes humanos relacionados con el cáncer.
Biblioteca de detección de ARNm lentiviral humano agrupado Dharmacon™ Decode™
Las bibliotecas de detección de ARN lentiviral de Decode son grupos de ARNhc Dharmacon™ GIPZ™. Mediante el silenciamiento mediado por ARNhc de cientos o miles de genes en paralelo, se puede realizar una detección de ARNhc lentiviral agrupada para identificar genes que regulan las respuestas celulares y las vías de señalización, o para descubrir nuevas funciones genéticas.
Para obtener más información sobre esta biblioteca, consulte Sitio web de Dharmacon.
Bibliotecas lentivirales humanas y de ratón shRNA agrupadas DECIPHER™ de CELLECTA
Estos shRNA lentivirales con código de barras se crearon para cubrir todos los conjuntos de genes humanos y murinos anotados con un alto porcentaje de secuencias validadas funcionalmente y la inclusión de un conjunto redundante de cinco a seis shRNA por gen. Las bibliotecas DECIPHER se dividen en módulos: tres módulos para humanos y dos módulos para ratones. Cada módulo se dirige a aproximadamente 5,000 genes ̶ asociados de diversas maneras con enfermedades, dianas farmacológicas conocidas o vías de señalización ̶ y representa más de 25,000 18 shRNA únicos. Las bibliotecas utilizan códigos de barras optimizados de XNUMX nt que facilitan la identificación de shRNA funcionales y el análisis de datos de secuenciación de alto rendimiento utilizando la plataforma Illumina.
Para obtener más información sobre estas bibliotecas, consulte Sitio web de Cellecta.
Biblioteca de ORF lentivirales humanos de primera línea de MGC
Esta biblioteca de expresión de ORF lentiviral humana se desarrolló a través de los esfuerzos de colaboración del Instituto de Cáncer Dana-Farber, el Instituto Broad y el Centro de Biología de Sistemas del Cáncer (CCSB). La colección incluye 15597 clones que abarcan 12861 genes.
Para obtener más información sobre estas bibliotecas, consulte Sitio web de Transomic.
Bibliotecas agrupadas de CRISPRi y CRISPRa a escala del genoma humano
Biblioteca de ARN guía único (sgRNA) CRISPRa del laboratorio de Jonathan Weissman (versión 1)
- Con el sistema SunCas9 con 10 sgRNA para cada sitio de inicio de transcripción (TTS) en 15,977 genes humanos y 5,968 controles para un total de 198,810 sgRNA en total
- Sistemas constitutivos o regulados por tetraciclina disponibles
- Cobertura 190X
Biblioteca de ARNm sg CRISPRi del laboratorio de Jonathan Weissman (versión 1)
- 10 sgRNA para cada TSS en 15,977 genes humanos y 11,219 controles para un total de 206,421 sgRNA en total
- Cobertura 290X
- Prueba de micoplasma basada en PCR para el monitoreo rutinario de líneas de cultivo de tejidos
- Empaquetado retroviral o lentiviral de construcciones proporcionadas por el usuario
- Producción de virus infecciosos a partir de vectores adicionales proporcionados por el núcleo, incluidos aquellos para la inmortalización celular, la regulación de TET y el seguimiento
- Maxiprep de ADN plasmídico basado en CsCl
Servicios y tarifas
| Producto o servicio | 1-5 Construcciones | >5 Construcciones |
|---|---|---|
| Stock de glicerol – shRNA o ORF | $52.50 | $26 |
| ADN plasmídico – shRNA o ORF | $77 | $61 |
| Producción de virus para infección de líneas celulares. | $118 | $94 |
| Infección de línea celular y selección de antibióticos | $161 | $112 |
| Pruebas de micoplasma | $37.50 | $20 |
| Maxiprep de ADN plasmídico purificado con CsCl | $246.50 | $145 |
| Transformación bacteriana | $55.50 | $54.50 |
* ADN plasmídico de bibliotecas shRNA o CRISPR agrupadas: comuníquese para conocer los precios
* Sobrenadante lentiviral de alto título de bibliotecas agrupadas de shRNA o CRISPR: comuníquese para conocer los precios
Haga un pedido
Pruebas de micoplasma
Formulario de solicitud de prueba de micoplasma
Clones de shRNA individuales
- Para realizar un pedido, necesitará el nombre oficial del gen. Este es Disponible en el sitio web del NCBI.
- En la ventana de búsqueda, seleccione “gen” y escriba el nombre o alias del gen.
- Para encontrar construcciones de shRNA disponibles para el gen de su interés, visite este enlacePuede buscar por nombre oficial del gen o por número de acceso. Deberá proporcionar el ID del clon y la dirección de la placa.
- Las solicitudes de clones y las preguntas sobre precios y disponibilidad se pueden enviar a renae.holtz@roswellpark.org.
Formulario de pedido de clon de shRNA individual
Plásmidos suministrados por PI
Formulario de pedido de plásmidos suministrados por PI
Clones LentiORF
- Para realizar un pedido, necesitará el nombre oficial del gen. Este es Disponible en el sitio web del NCBI.
- En la ventana de búsqueda, seleccione “gen” y escriba el nombre o alias del gen.
- Para encontrar construcciones LentiORF disponibles para el gen de su interés, visite este enlace.
- Puede buscar por nombre oficial del gen o por número de acceso. Deberá proporcionar el ID del clon y la dirección de la placa.
- Las solicitudes de clones y las preguntas sobre precios y disponibilidad se pueden enviar a renae.holtz@roswellpark.org.
Formulario de pedido de clonación de LentiORF
Seguimiento de plásmidos como Luciferasa o GFP
Formulario de pedido de seguimiento de plásmidos
Producción de plásmido CsCl
Ubicación y horario
Centro de cáncer integral de Roswell ParkRecursos de servicios de modulación genética
Centro de Genética y Farmacología (CGP), Sala L2-135
Calles Elm y Carlton
Buffalo, NY 14263
Lunes a viernes, 8:30 am - 4:30 pm
Por favor, póngase en contacto con:
Irwin Gelman, Doctor en Filosofía
Director
Teléfono: 716-845-7681
Correo electrónico: Irwin Gelman@RoswellPark.org
Nuestro equipo
Información de Contacto
Para consultas y preguntas sobre diseño experimental, comuníquese con el Dr. Gelman.
Teléfono: 716-845-7681
Correo electrónico: Irwin Gelman@RoswellPark.org
Utilizando el recurso
Los investigadores interesados en servicios de modulación genética o pruebas de micoplasma deben comunicarse con:
Renae Holtz
Teléfono: 716-845-1585
Correo electrónico: Renae.Holtz@RoswellPark.org