Qué hacemos
La misión del Recurso Compartido de Bioestadística y Genómica Estadística (BSGSR) es colaborar en el diseño, la supervisión, la implementación, el análisis, la publicación y la presentación de informes de estudios científicos realizados por profesores y personal del Roswell Park Comprehensive Cancer Center.
Esto incluye la articulación de los objetivos y las hipótesis del estudio, la redacción de solicitudes de subvenciones, la concepción de diseños y modelos adecuados y rentables para el logro de los objetivos del estudio, la garantía de que se utilicen métodos estadísticos modernos y apropiados, el seguimiento de los análisis provisionales y finales y la coautoría de resúmenes y manuscritos.
La experiencia dentro del recurso abarca toda la gama de bioestadística, epidemiología molecular y genética y genómica estadística.
- Desarrollo de biomarcadores
- Métodos de bootstrap y remuestreo
- Diseño y análisis de ensayos clínicos
- Métodos computacionalmente intensivos
- Pruebas de diagnostico
- Métodos estadísticos epidemiológicos
- Prueba exacta
- Métodos de datos longitudinales
- Estadística matemática
- Modelado de errores de medición
- simulación del Monte Carlo
- Modelado no lineal
- Educación estadística
- Métodos de supervivencia y datos censurados
El BSGSR incluye experiencia en genética estadística y genómica y colabora estrechamente con el Recurso compartido de bioinformática y la Recurso compartido de informática para la investigación biomédicaLos proyectos de colaboración con frecuencia abarcan estas cuatro áreas (bioestadística, genética y genómica, bioinformática y desarrollo de bases de datos) y los tres equipos trabajan juntos para abordar las preguntas científicas que a menudo se superponen en el estudio.
En el caso de los ensayos clínicos, BSGSR trabaja en estrecha colaboración con el investigador y los Servicios de Investigación Clínica (CRS) en todas las fases del ensayo: desde el desarrollo del protocolo, el desarrollo de la base de datos de ensayos clínicos, el seguimiento del estudio y los análisis provisionales, hasta los análisis finales y los informes del ensayo (incluido clinicaltrials.gov).
Para solicitar soporte bioestadístico, por favor Realizar una solicitud utilizando el Sistema de Gestión de Información de Laboratorio (LIMS).
Solicitar apoyo bioestadísticoObtenga más información sobre el BSGSR
Ecológica
Equipos de bioestadística y genómica estadística:
- Estaciones de trabajo de microcomputadoras
- SAS® Software
- Software de cálculo estadístico R
- Mathematica®
- Software PASS de análisis de potencia y tamaño de muestra
- PERL
- Cáscara
- Plink
- GATO
- Clúster de computación de alto rendimiento Linux (1,600 procesadores, 200 TB de almacenamiento)
Servicios y tarifas
Los servicios incluyen:
- Análisis exploratorio de datos
- Redacción de propuestas de subvención (secciones de métodos estadísticos)
- Formulación de hipótesis
- Diseño de ensayos clínicos
- Diseño experimental
- Ajuste de modelos a los datos
- Desarrollo de nuevos métodos estadísticos
- Informe de resultados a clinicaltrials.gov
- Desarrollo de software de minería de datos personalizado y desarrollo de métodos novedosos basados en tecnologías emergentes (por ejemplo, plataformas de microarrays de vanguardia, métodos estadísticos intensivos en computación)
- Formación y educación estadística
- Programación estadística y desarrollo de bases de datos
- Desarrollo de software estadístico
- Presentación gráfica de resultados
- Escritura de manuscritos
Se da prioridad a los miembros e investigadores del Programa de Subvenciones de Apoyo al Centro Oncológico (CCSG) que cuentan con financiación externa, un ensayo clínico aprobado o que están preparando protocolos y/o solicitudes de subvenciones.
Política de tarifas
- Sin tarifas ni devoluciones de cargos por servicios de consultoría o desarrollo
- Porcentaje apropiado de esfuerzo en subvenciones
Nuestro equipo
Kayla Catalfamo, MA
Bioestadístico
Teléfono: 716-845-1300 ext. 7217
Correo electrónico: Kayla.Catalfamo@RoswellPark.org
Adrienne Groman, Máster
Bioestadístico Senior
Teléfono: 716-845-1300 ext. 6274
Correo electrónico: Adrienne.Groman@RoswellPark.org
Zhe Jing, Máster y Máster en Salud Pública
Bioestadístico Senior
Teléfono: 716-845-1300 ext. 2589
Correo electrónico: Zhe.Jing@RoswellPark.org
Ram Nambiar, Maestro
Bioestadístico
Teléfono: 716-845-1300 ext. 2216
Correo electrónico: Ram.Nambiar@RoswellPark.org
Katy Wang, Maestría
Bioestadístico Senior
Teléfono: 716-845-1300 ext. 6269
Correo electrónico: Katy Wang @ Roswell Park.org
Lacey Yuan, MA
Bioestadístico
Teléfono: 716-845 1300-x 2652
Correo electrónico: Guangwei.Yuan@RoswellPark.org
Ubicación y horario
Centro de cáncer integral de Roswell Park
Recurso compartido sobre bioestadística y genómica estadística
Centro de Estudios e Investigaciones - 4to Piso
Calles Elm y Carlton
Buffalo, Nueva York 14263
Lunes a viernes, 8 am - 5 pm
Este recurso compartido está financiado por NCI P30CA16056. Las publicaciones deben citar la subvención principal en la sección de agradecimientos si utilizan datos generados por el recurso compartido. También se deben enviar dos copias de la publicación que reconozca la subvención principal a la instalación ubicada en las calles Elm y Carlton, Buffalo, NY 14263.
El Recurso de Bioestadística y Genómica Estadística (BSGSR) garantiza la disponibilidad inmediata de apoyo bioestadístico para los colaboradores del Centro Oncológico Integral Roswell Park, tanto en sus áreas básica, clínica y poblacional. Los servicios incluyen análisis exploratorio de datos, redacción de solicitudes de subvención, formulación de hipótesis, diseño experimental, ajuste de modelos a los datos, simulación de datos a partir de modelos y desarrollo de nuevos métodos basados en tecnologías emergentes. Además, el BSGSR desarrolla nuevas metodologías estadísticas y aplicaciones de software para el análisis de datos generados por experimentos que utilizan biotecnologías emergentes. Asimismo, el BSGSR contribuirá al desarrollo y diseño óptimo de biotecnologías emergentes en Roswell Park.
Publicaciones seleccionadas
- Hutson, A. y Yu, H. (2021) Una prueba de permutación robusta para el coeficiente de correlación de concordancia. Pharmaceutical Statistics (en prensa). …disponible en línea
- Hutson, AD y Vexler, A. (2018) Una nota de advertencia sobre las familias beta de distribuciones y los alias dentro de ellas. The American Statistician, 72 121-129.
- Mark Farrugia, Han Yu, Sung Jun Ma, Austin J. Iovoli, Kristopher Attwood, Kimberly E. Wooten, Hassan Arshad, Vishal Gupta, Ryan P. McSpadden, Moni A. Kuriakose, Micheal R. Markiewicz, Jon M. Chan, Wesley L. Hicks Jr, Mary E. Platek, Andrew D. Ray, Elizabeth A. Repasky, Anurag K. Singh. Un componente principal de las medidas de calidad de vida se asocia con la supervivencia de los pacientes con cáncer de cabeza y cuello tratados con radioterapia. Cancers. (En prensa). https://doi.org/10.3390/cancers13051155
- Ranjan Pathak, Gilberto De Lima Lopes, Han Yu, Madan Raj Aryal, Wenyan Ji, Katherine Stemmer Frumento, Christopher JD Wallis, Zachary Klaassen, Henry S Park, Sarah B Goldberg. Eficacia comparativa de la quimioinmunoterapia frente a la inmunoterapia para el cáncer de pulmón de células no pequeñas avanzado: un metanálisis en red de ensayos aleatorizados. Cancer. 2021; 127(5):709-719. PMID: 33119177
- Mi Yang y Francesca Petralia, Zhi Li, Hongyang Li, Weiping Ma, Xiaoyu Song, Sunkyu Kim, Heewon Lee, Han Yu, Bora Lee, Seohui Bae, Eunji Heo, Jan Kaczmarczyk, Piotr Stepniak, Michal Warchol, Thomas Yu, Anna P. Calinawan, Paul C. Boutros, Samuel H. Payne, Boris Reva, Consorcio NCI-CPTAC-DREAM, Emily Boja, Henry Rodriguez, Gustavo Stolovitzky, Yuanfang Guan, Jaewoo Kang, Pei Wang, David Fenyo, Julio Saez-Rodriguez. Evaluación comunitaria de la predictibilidad de los niveles de proteínas y fosfoproteínas del cáncer a partir de la genómica y la transcriptómica. Cell Systems. 2020; 11 (2), 186-195. PMID: 32710834
- Han Yu, Janhavi Moharil, Rachael Hageman Blair. BayesNetBP: un paquete R para razonamiento probabilístico en redes bayesianas. Journal of Statistical Software. 2020; 94(3), 1–31.
- Lina Mu, Zhongzheng Niu, Rachael Hageman Blair, Han Yu, Richard W Browne, Matthew R Bonner, Tiffany Fanter, Furong Deng, Mya Swanson. Perfiles metabolómicos antes, durante y después de los Juegos Olímpicos de Pekín: un estudio de panel sobre las diferencias intraindividuales durante períodos de alta y baja contaminación del aire. Perspectivas de salud ambiental. Perspectivas de salud ambiental. 2019; 127(5): 057010. PMID: 3114088
- Zhu et al. La secuenciación del exoma completo de familias con cáncer de ovario revela genes de predisposición putativos. Revista internacional del cáncer. 2020.
- Yao y Zhu et al. Ascendencia genética y toxicidades esqueléticas entre pacientes con leucemia linfoblástica aguda infantil en la cohorte DFCI 05-001. Blood Advances. 2020
- Attwood K y Tian L. Estimación del intervalo de confianza del índice de Youden y punto de corte correspondiente para una combinación de biomarcadores en condiciones de normalidad. Communications in Statistics – Theory and Methods. 2020. DOI: 10.1080/03610926.2020.1751852.
- Zsiros E, Lynam S, Attwood KM, Wang C, Chilakapati S, Cortes Gomez E, Liu S, Akers S, Lele S, Frederick PJ y Odunsi K. Eficacia y seguridad de pembrolizumab en combinación con bevacizumab y ciclofosfamida metronómica oral en el tratamiento del cáncer de ovario recurrente: un ensayo clínico de fase 2 no aleatorizado. JAMA Oncology 2021; 7(1): 78-85.
- Shah R, Attwood K, Arya S, Hall DE, Johanning JM, Gabriel E, Visioni A, Nurkin S, Kukar M, Hochwald S y Massarweh NN. Asociación de fragilidad con la falta de rescate después de cirugías hospitalarias de bajo y alto riesgo. JAMA Surgery. 2018; 153(3): e180214.