Explorando la genómica del cáncer
Como biólogo computacional, mi investigación se centra en comprender los mecanismos de iniciación, progresión y pronóstico del cáncer mediante el desarrollo y la utilización de métodos computacionales.
Mis áreas de investigación recientes incluyen:
- Identificación de la mutación impulsora, la etiología, el mecanismo y la heterogeneidad en los genomas del cáncer humano y del ratón
- Detección ultrasensible de lesiones cancerosas y precancerosas mediante mutaciones somáticas
- Desarrollo de software computacional innovador e integrador de código abierto para analizar datos genómicos
- Interpretación precisa de variantes genómicas complejas mediante anotaciones que tienen en cuenta los haplotipos
La investigación actual
Genómica del cáncer y evolución de los tumores
La secuenciación de nueva generación (NGS) se ha vuelto ampliamente accesible en los laboratorios clínicos y de investigación. Mediante la secuenciación de todo el genoma, todo el exoma y los transcriptomas, podemos detectar varios tipos de variantes.
Detección ultrasensible de mutaciones en tejidos tumorales y normales
Hemos realizado estudios innovadores con el objetivo de ampliar nuestros límites de detección a mutaciones de frecuencia muy baja (<5%), que son importantes para la detección temprana del cáncer y el monitoreo de la enfermedad residual.
Neoantígenos específicos de tumores para inmunoperfiles
Diseñamos el gráfico de luces de Navidad (Christmas Light Plot, CLP) para visualizar fácilmente los neoantígenos identificados. El CLP incorpora criterios predefinidos para la priorización de neoantígenos.
Paisajes mutacionales en modelos preclínicos
Los análisis de mutaciones somáticas en ratones plantean un desafío único debido a los diversos antecedentes genéticos en GEM y a la contaminación del estroma del ratón en los modelos PDX.
Recurso compartido de bioinformática
El Dr. Wei es codirector de esta instalación científica central.
Ver recurso compartidoEl equipo de Wei Lab
Nuestro laboratorio está formado por los mejores y más brillantes profesionales.
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Centro de cáncer integral de Roswell Park
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