puestos de trabajo
Centro de cáncer integral de Roswell Park
- Profesor Asociado de Oncología
- Codirector del Centro de Recursos de Bioinformática
- Departamento de Bioestadística y Bioinformática
Fondo
Educación y Entrenamiento
- Doctorado - Universidad Estatal de Nueva York en Buffalo
- Licenciatura en Ciencias - Universidad de Ciencia y Tecnología de China
Compañerismo
- Becario postdoctoral - St. Jude Children's Research Hospital
Resumen de la investigación
El Dr. Wei es un biólogo computacional financiado por el programa R01. Sus investigaciones se centran en el desarrollo y la utilización de algoritmos computacionales integradores para comprender la genómica del cáncer y otras cuestiones biológicas. Las áreas de investigación actuales del Dr. Wei incluyen:
- Detección ultrasensible de lesiones cancerosas y precancerosas mediante mutaciones somáticas.
- Interpretación precisa de variantes genómicas complejas mediante anotaciones que tienen en cuenta el haplotipo.
- Identificar la mutación impulsora, la etiología, el mecanismo y la heterogeneidad en los genomas del cáncer humano y del ratón.
- Desarrollar software computacional innovador e integrador de código abierto para la genómica del cáncer.
El Dr. Wei fue invitado a presentar "Mutaciones clonales epidérmicas inducidas por rayos UV y nuevos conocimientos para la prevención del cáncer de piel" en el seminario web de Ciencias Ambientales y Prevención del Cáncer (ESCP), División de Prevención del Cáncer, Instituto Nacional del Cáncer, Institutos Nacionales de Salud, el 22 de enero de 2026.
https://prevention.cancer.gov/news-and-events/meetings-and-events/environmental-exposure-related-risk-skin-cancer-webinar
Publicaciones
Yao S*, Wei L*, Hu Q*, Liu S*, Manojlovic Z, Fiorica PN, Long M, Zirpoli GR, Cai Q, Long J, Ping J, Barnard ME, Jin Y, Murakami M, Wang J, Zhu Q, Davis W, Chen J, Ondracek RP, Khoury T, Gandhi S, Takabe K, Ko N, Sanderson M, Hong CC, Bandera EV, Craig DW, Ambrosone CB, Palmer JR, Zheng W, Carpten JD. Panorama mutacional del cáncer de mama triple negativo en mujeres afroamericanas. Nature Genetics. Septiembre de 2025;57(9):2166-2176. doi: 10.1038/s41588-025-02322-y. Publicación electrónica, 26 de agosto de 2025. PMID: 40858906
Wei L§, Fitzgerald ME, Yan L, Murakami M, Grant SR, Hu Q, Fan S, Okai B, Goyal D, Singh PK, Shafirstein G, Remenyik E, Gellen E, Foster BA§, Huss WJ§, Paragh G§. La terapia fotodinámica reduce la carga de pequeños clones epidérmicos inducidos por la radiación ultravioleta en piel humana y de ratón. Br J Dermatol. 27 de agosto de 2024: ljae314. doi: 10.1093/bjd/ljae314. PMID: 39189591
Grant SR, Rosario SR, Patentreger AD, Shary Nico, Fitzgerald ME, Singh PK, Foster BA, Huss WJ, Wei L, Paragh G. HotSPOT: Una herramienta computacional para diseñar paneles de secuenciación dirigidos para evaluar la fotocarcinogénesis temprana. Cancers. 2023, 15(5), 1612; https://doi.org/10.3390/cancers15051612
Merz M*, Merz A*, Wang J*, Wei L*, Hu Q, Hutson N, Rondeau C, Celotto K, Belal A, Alberico R, Block AW, Mohammadpour H, Wallace PK, Tario J, Luce J, Glenn SJ, Singh P, Herr MM, Hahn T, Liu S, McCarthy PL, Hillengass J. Descifrando la heterogeneidad espacial con una resolución unicelular en el mieloma múltiple. Nature Communications. 10 de febrero de 2022;13(1):807. doi: 10.1038/s41467-022-28266-z. PMID: 35145077
Hutson N, Zhan F, Graham J, Murakami M, Zhang H, Ganaparti S, Hu Q, Yan L, Ma C, Liu S, Xie J§, Wei L§. Un método adaptativo para definir el estado de mutación negativo para la comparación de múltiples muestras mediante secuenciación de nueva generación. BMC Medical Genomics. 2 de diciembre de 2021;14(Supl. 2):32. doi: 10.1186/s12920-021-00880-8. PMID: 34856988
Wei L*§, Christensen S*, Fitzgerald M, Graham J, Hutson N, Zhang C, Huang Z, Hu Q, Zhan F, Xie J, Zhang J, Liu S, Remenyik E, Gellen E, Colegio O, Lin H, Bax M, Xu J, Huss WJ, Foster BA, Paragh G§. La secuenciación ultraprofunda diferencia patrones de mutaciones clonales cutáneas asociadas con la exposición solar y la incidencia de cáncer de piel. Science Advances. Enero de 2021; Vol. 7, n.º 1; DOI: 10.1126/sciadv.abd7703. PMID: 33523857.
Wei L*, Hussein AA*, Ma Y*, Azabdaftari G, Ahmed Y, Wong LP, Hu Q, Luo W, Cranwell VN, Bunch BL, Kozlowski JD, Singh PK, Glenn ST, Smith G, Johnson CS, Liu S, Guru KA. La cuantificación precisa de células cancerosas residuales en el lavado pélvico revela una asociación con la recurrencia del cáncer tras una cistectomía radical asistida por robot. Journal of Urology. Junio de 2019;201(6):1105-1114. doi: 10.1097/JU.0000000000000142.
Huss WJ, Hu Q, Glenn ST, Gangavarapu KJ, Wang J, Luce JD, Quinn PK, Brese EA, Zhan F, Conroy JM, Paragh G, Foster BA, Morrison CD, Liu S, Wei L. Comparación del rendimiento de captura de exomas de SureSelect y Nextera en la secuenciación unicelular. Human Heredity. 2018;83(3):153-162.
Wei L*, Wang J*, Lampert E, Schlanger S, DePriest AD, Hu Q, Gomez EC, Murakami M, Glenn ST, Conroy J, Morrison C, Azabdaftari G, Mohler JL, Liu S, Heemers HV. La heterogeneidad genómica intratumoral e intertumoral del cáncer de próstata localizado multifocal afecta a las clasificaciones moleculares y los pronosticadores genómicos. Urología Europea. Febrero de 2017;71(2):183-192.
Wei L*§, Liu LT*, Conroy JR, Hu Q, Conroy JM, Morrison CD, Johnson CS, Wang J, Liu S§. MAC: identificación y corrección de anotaciones para variaciones multinucleotídicas. BMC Genomics. 1 de agosto de 2015;16:569.
Holmfeldt L*, Wei L*, Diaz-Flores E, Walsh M, Zhang J, Ding L, Payne-Turner D, Churchman M, Andersson A, Chen SC, McCastlain K, Becksfort J, Ma J, Wu G, Patel SN, Heatley SL, Phillips LA, Song G, Easton J, Parker M, Chen X, Rusch M, Boggs K, Vadodaria B, Hedlund E, Drenberg C, Baker S, Pei D, Cheng C, Huether R, Lu C, Fulton RS, Fulton LL, Tabib Y, Dooling DJ, Ochoa K, Minden M, Lewis ID, To LB, Marlton P, Roberts AW, Raca G, Stock W, Neale G, Drexler HG, Dickins RA, Ellison DW, Shurtleff SA, Pui CH, Ribeiro RC, Devidas M, Carroll AJ, Heerema NA, Wood B, Borowitz MJ, Gastier-Foster JM, Raimondi SC, Mardis ER, Wilson RK, Downing JR, Hunger SP, Loh ML, Mullighan CG. Panorama genómico de la leucemia linfoblástica aguda hipodiploide. Nature Genetics. Marzo de 2013;45(3):242-52.